Ученые из системы Mass General Brigham разработали новый метод жидкостной биопсии, способный обнаружить рак головы и шеи, вызванный вирусом папилломы человека (ВПЧ), за годы до проявления первых симптомов, пишет EurekAlert.
Рак головы и шеи, связанный с ВПЧ, составляет около 70% подобных случаев в США, и его частота растет каждый год. В отличие от рака шейки матки, для этих опухолей нет скрининговых тестов, поэтому диагноз обычно ставится на поздних стадиях, когда опухоль уже разрослась и распространилась на лимфоузлы.
Новый инструмент под названием HPV-DeepSeek использует полногеномное секвенирование для поиска микроскопических фрагментов ДНК вируса, попадающих в кровь из опухоли. Ранее команда показала, что этот метод достигает 99% чувствительности и специфичности при диагностике у пациентов, впервые обратившихся в клинику.
В свежем исследовании ученые проанализировали 56 образцов крови: 28 принадлежали людям, у которых годы спустя развился рак головы и шеи, и 28 — здоровым добровольцам. HPV-DeepSeek обнаружил вирусные фрагменты у 22 будущих пациентов, при этом все образцы из контрольной группы оказались отрицательными. Самый ранний положительный результат был зафиксирован за 7 лет 8 месяцев до постановки диагноза.
После применения методов машинного обучения точность анализа повысилась: удалось правильно выявить 27 из 28 будущих случаев заболевания, включая образцы, собранные за 10 лет до диагностики.
Авторы подчеркивают, что раннее выявление позволит начать щадящее лечение и значительно улучшить качество жизни пациентов. Сейчас результаты проходят проверку во втором масштабном исследовании при поддержке Национального института здоровья США.
Исследование опубликовано в Journal of the National Cancer Institute.